Les projets doivent associer au moins un établissement de conservation et un établissement d’enseignement et/ou de recherche, quels qu’ils soient. Ces opérations, dénommées « projets partenariaux Biblissima », sont réalisées à l'issue d'une sélection de projets déposés auprès de l'équipex en réponse à l'appel à manifestation d'intérêt, détaillé pour l'année 6 (2018) dans le règlement téléchargeable sur le site Internet de Biblissima.